We Create True Value From Technology Innovation

Giới thiệu về Viện Wellcome Sanger

• Viện Wellcome Sanger là đơn vị hàng đầu thế giới về nghiên cứu bộ gen, cung cấp những hiểu biết sâu sắc về sinh học của con người và tác nhân gây bệnh, làm thay đổi khoa học và y học. Viện tọa lạc tại Khuôn viên Wellcome Genome ở Cambridgeshire, trung tâm của một trung tâm nghiên cứu bộ gen cơ bản và ứng dụng toàn cầu.

Thách thức

• Theo chương trình Tree of Life, Viện Wellcome Sanger đang dẫn đầu sáng kiến ​​giải mã bộ gen của 72.000 sinh vật sống được tìm thấy ở Anh và Ireland. Dự án khổng lồ này liên quan đến việc tiếp nhận hàng nghìn mẫu từ nhiều đối tác trên khắp cả nước: bảo tàng, vườn bách thảo, tổ chức nghiên cứu, trường đại học, v.v.
• Thay vì phụ thuộc vào các bảng tính và quy trình thủ công để ghi lại và theo dõi các mẫu - mỗi mẫu có thể có khoảng 50 phần siêu dữ liệu liên quan - Viện cần một hệ thống phần mềm cho phép họ quản lý hiệu quả, nhanh chóng và hiệu quả hành trình của từng mẫu trong suốt quá trình, cung cấp cho các thành viên trong nhóm ở các phòng ban khác nhau quyền truy cập vào thông tin cập nhật và theo thời gian thực bất cứ khi nào họ cần.

Cách tiếp cận của chúng tôi

• Chúng tôi bắt đầu bằng cách chạy một chương trình khám phá toàn diện để giải quyết tình hình hiện tại với các thành viên nhóm của Viện và hiểu đầy đủ trạng thái cuối mong muốn.
• Trong 10 tuần, MVP của giải pháp đã sẵn sàng để đưa vào hoạt động. Kể từ đó, chúng tôi đã tiếp tục tối ưu hóa và cải tiến các tính năng cụ thể khi cần theo tinh thần cải tiến liên tục, chẳng hạn như liên kết dữ liệu trình tự hạ lưu trở lại từng mẫu, cũng như mở rộng chức năng của hệ thống.

Giải pháp

• Chúng tôi đã cung cấp một giải pháp phần mềm riêng cho Viện, cho phép các thành viên nhóm theo dõi từng mẫu nhận được trên cơ sở đầu cuối.
• Được lưu trữ trên đám mây riêng, có một giao diện người dùng duy nhất. Được viết bằng mã nguồn mở (Python), API mở được sử dụng có nghĩa là hệ thống dễ bảo trì, có thể mở rộng hoàn toàn và có thể được kết nối an toàn với các cơ sở dữ liệu rộng hơn của Châu Âu và phần còn lại của thế giới khi chúng được phát triển theo chương trình.

Kết quả

• Tốc độ, hiệu quả và độ chính xác của dự án đã được tăng lên đáng kể và các mẫu, cùng với siêu dữ liệu của chúng, có thể được ghi lại và ghi lại trong thời gian ngắn hơn nhiều so với trước đây.
• Có ít chỗ cho lỗi hoặc không chính xác hơn nhiều khi các quy trình thủ công và nhập dữ liệu đã bị loại bỏ. Viện có một hệ thống có thể dễ dàng cấu hình cho các dự án khác nữa – do đó thể hiện lợi tức đầu tư cao.